文件系统格式指为了使文件存储于硬盘、USB接口等设备上可以被计算机系统正确识别和读取的格式化方式，常见的文件系统格式有FAT32、NTFS、HFS 等。FAT32由于兼容性较高，常被用于移动设备和U盘上。NTFS则被广泛应用在Windows系统中。HFS 则是苹果公司设计用于Mac系统的文件系统格式。
文件系统格式除了对存储介质的兼容性和性能有较大的影响外，还可能产生文件权限问题。例如，在FAT32格式的U盘插入Windows系统后复制的某些具有特殊权限的文件，可能因为文件权限问题，而无法在其他系统下打开。而NTFS格式则由于支持文件权限控制，更加安全，可被广泛应用于办公环境中。
除了常见的FAT32、NTFS、HFS 文件系统格式外，目前也出现了一些新的文件系统格式，例如ZFS和Btrfs。这些新的格式可能具有更高的容错性和可靠性，对于企业级应用和庞大的数据存储系统具有重要意义。
